Présentation de l’IGM
Etude du transcriptome
L’étude du transcriptome repose en particulier sur la technologie des biopuces, ou puces à ADN , qui cherche à détecter les ARNm présents dans un mélange donné. L’analyser consiste à identifier, à un temps t, les séquences codantes du génome qui sont effectivement exprimées. Plusieurs dizaines milliers de résultats peuvent être obtenus simultanément.
Les puces à ADN
Le concept de biopuce (= puce à ADN) est né dans les années 1990. Il repose sur une technologie pluridisciplinaire intégrant la micro-électronique, la chimie des acides nucléiques, l’analyse d’images et la bioinformatique.
Le principe de la puce à ADN est basé sur la technique d’ hybridation . Immobilisés sur un support solide (matrice), des oligonucléotides (simples brins) spécifiques de différents gènes ou ADNc connus constituent les sondes dont le rôle est de détecter des cibles marquées complémentaires, présentes dans le mélange complexe à analyser ( ARNm extraits de cellules, tissus ou organismes entiers et convertis en ADNc). Les signaux d’hybridation sont détectés selon le type de marquage, radioactivité ou fluorescence, par mesure radiographique ou par fluorescence, et quantifiés.
Utilisation de la plateforme
ArraySud réalise le design des oligonucléotides, le plan d’expériences, l’hybridation et l’analyse.
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