Présentation de l’IGM
Équipe de Patrick FORTERRE
Thématique dirigée par Marc NADAL, Professeur, Université de Versailles-Saint-Quentin
Composition du groupe
Marc NADAL, Professeur, Université de Versailles-Saint-Quentin
Florence GARNIER, Maître de Conférences, Université Versailles St-Quentin-en-Yvelines
Hélène DEBAT, Maître de Conférences, Université Versailles St-Quentin-en-Yvelines
Anna BIZARD, Doctorante (2008-)
Mohéa COUTURIER, Doctorante
Projet
Notre objectif est de mieux comprendre les différents rôles des ADN topoisomérases. Ces enzymes jouent un rôle clef dans le métabolisme de l’ADN ; il est donc important de définir les différents niveaux de régulation de telles protéines. L’étude de ces protéines suggère par ailleurs une modulation fine de leur action car elles sont dépendantes des conditions physico-chimiques de l’environnement et de l’état physiologique de la cellule. Parmi les topoisomérases, une sous-famille, les topoisomérases IA nous intéressent plus particulièrement car ce sont les seules présentes chez l’ensemble des organismes vivants. De plus, nous savons qu’elles participent activement à la stabilité des génomes. Tous les organismes hyperthermophiles, qui vivent dans un environnement particulièrement défavorable en ce qui concerne la stabilité de leur génome, possèdent une topoisomérase IA particulière, la reverse gyrase, qui est impliquée dans des processus de réparation de l’ADN. Cette topoisomérase est capable de surenrouler positivement l’ADN, ce qui permet vraisemblablement de stabiliser l’ADN à haute température. En effet, sur un tel ADN, il est beaucoup plus difficile de séparer les deux brins de la double hélice.
Ainsi, le génome de S. solfataricus, l’organisme modèle que nous étudions au laboratoire, code pour une topoisomérase VI et trois topoisomérases IA : une topoisomérase IA « classique » et deux reverse gyrases. Notre objectif est de clarifier le rôle de chacune de ces topoisomérases et en particulier des deux reverse gyrases. A cette fin, nous étudierons leurs activités et nous déterminerons leurs régulations à la fois in vivo et in vitro.
Mots-clés : Archaea, Hyperthermophiles, Réplication, Réparation, Recombinaison, Topoisomérases, reverse gyrase.
Publications récentes
Valenti, A., De Felice, M., Perugino, G., Bizard, A., Nadal, M., Rossi, M., & Ciaramella, M. (2012). Synergic and opposing activities of thermophilic RecQ-like helicase and Topoisomerase 3 in Holliday junction processing and replication fork stabilization. J. Biol. Chem. 287 : 30282-30295
Bizard A, Garnier F and Nadal M, (2011), TopR2, the second reverse gyrase of Sulfolobus solfataricus, exhibits unusual properties, J Mol Biol 408 : 839-849
Jing Ye, Christelle Lenain, Serge Bauwens, Angela Rizzo, Adelaïde Saint-Léger , Anaïs Poulet, Delphine Benarroch, Frédérique Magdinier, Julia Morere, Simon Amiard , Els Verhoeyen, Sébastien Britton, Patrick Calsou, Bernard Salles, Anna Bizard, Marc Nadal, Erica Salvati, Laure Sabatier, Yunlin Wu, Annamaria Biroccio, Arturo Londoño-Vallejo, Marie-Josèphe Giraud-Panis and Eric Gilson, (2010), TRF2 and Apollo cooperate with Topoisomerase 2alpha to protect human telomeres from replicative damage, Cell, 142:230-42
Garnier F and Nadal M, (2008), Transcriptional analysis of the two reverse gyrase encoding genes of Sulfolobus solfataricus P2 in relation to the growth phases and temperature conditions, Extremophiles 12 : 799-809
Corel E, El Fegalhi R, Gérardin F, Hoebeke M, Nadal M, Grossmann A and Devauchelle C, (2007), Local Similarities and Clustering of Biological Sequences : New Insights from N-local Decoding, The First International Symposium on Optimization and Systems Biology pp. 189–195
Nadal M, (2007), Reverse gyrase : an insight into the role of DNA-topoisomerases, Biochimie 89(4) : 447-55
Publications récentes réalisées à l’extérieur
Raliou M., Grauso M., Hoffmann B., Schlegel–Le-Poupon C., Nespoulous C., Débat H. , et al. , (2011). Human genetic polymorphisms in T1R1 and T1R3 taste receptor subunits affect their function. Chemical Senses 4:1-11
Smirnov, I. I., Carletti, E. E., Kurkova, I. I., Nachon, F. F., Nicolet, Y. Y., Mitkevich, V. A. V., Débat, H. H., et al. (2011). Reactibodies generated by kinetic selection couple chemical reactivity with favorable protein dynamics. Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 108 : 15954–15959.
Wilson A., Punginelli C., Couturier M., Perreau F., Kirilovsky D. (2010) Essential role of two tyrosines and two tryptophans on the photoprotection activity of the Orange Carotenoid Protein, Biochim. Biophys. Acta (Bioenergetics) 1807 : 293-301
Contact : Marc NADAL
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Enseignant Chercheur - Equipe Patrick FORTERRE Thématique : Régulation des ADN-topoisomérases Tél : 01 69 15 68 04 Bât. 409, pièce n°208 |