Séminaire
Etude de l’exoribonucléase 5’-3’ Xrn1 et de son co-facteur Dcs1 dans leurs effets directs, ou bien indirects, sur la respiration.
mardi 29 mai 2012 - 11:30-13:30
Lionel BENARD
Institut de Biologie Physico Chimique – Paris Diderot
Lieu : Salle de Conférences Pierre Schaeffer Bâtiment 409
Abstract :
Chez S. cerevisiae, le facteur Dcs1, Decapping scavenger, clive la coiffe des ARN messagers issus de la voie de dégradation 3’-5’. De manière indépendante, Dcs1 facilite l’activité de l’exoribonucléase 5’-3’cytoplasmique Xrn1. Contrairement aux modèles établis, nous montrons In vitro et in vivo que l’activité catalytique de Dcs1 n’est en rien responsable de ce contrôle sur Xrn1. Par ailleurs, nous confirmons in vitro que Dcs1, Dcs2 (paralogue de Dcs1 inactif dans le clivage de la coiffe) ainsi que le mutant catalytique de Dcs1 et DcpS (l’orthologue humain de Dcs1) sont tous des activateurs spécifiques de Xrn1. La présence de Dcs1 étant requise pour la croissance sur un milieu contenant du glycérol et nous nous sommes interrogés sur la part prise dans ce phénomène par l’activation de Xrn1 par Dcs1. Considérant l’impact sur le transcriptome et le protéome qui est attribué à la perte de l’activité de Xrn1, nous avons analysé l’effet d’une inhibition de l’activité de Xrn1 dans le contexte de mutants dcs, ceci par l’analyse de gels de protéines bidimensionnels. Nous observons qu’un groupe de protéines diminue en quantité dans cette souche mutante. De manière remarquable, certaines de ces protéines sont essentielles pour la respiration cellulaire, et sont systématiquement retrouvées en quantité moindre dans un mutant xrn1. Le maintien de l’activité de dégradation de Xrn1 par les facteurs Dcs apparaît ainsi nécessaire à la respiration. Nous proposons que l’activation de la ribonucléase Xrn1 permet d’éviter la stabilisation d’ARN dont l’accumulation inhiberait directement ou indirectement l’expression de facteurs nécessaires à la réalisation des fonctions mitochondriales.
Contact : Sylvie HERMANN-LE DENMAT
